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　　2003年，政策与管理所在经历了3年的预研究之后正式启动“中国未来二十年技术预见”研究，在勾勒了2020年中国社会发展的6个图景及其对科技的需求的同时，动员了国内近2000名专家学者，在大量可能的技术中，研究提出2020年中国最重要的737个技术课题，为遴选优先发展技术领域和技术课题提供了重要决策依据。在穆荣平看来，“目前中国科研多数是跟着国际热点走，对于未来发展方向，我们缺乏的是判断力。未来科技政策研究亟待解答的问题是：中国真正需要什么样的技术，需要重点发展什么技术”。“发展，意味着自我发展意识的增强，意味着承担更多的风险和不确定性。发展政策的研究者必须视野开阔、未雨绸缪。”穆荣平说，“我们希望在科技发展政策研究方面作出探索，面向决策、面向公众、面向科技工作者提供有价值的研究成果。”同年，“国家中长期科技发展规划”战略研究正式启动。“在战略研究全部20个专题中，政策与管理所主持了科技人才专题研究工作，实质参与了另外三个专题研究工作，有10多位研究人员参与战略研究工作，发挥了核心科技政策研究机构的作用。”

　　“十一五”期间，政策与管理所完成了“国家创新能力建设发展政策与措施研究”，承担并完成了《国家自主创新基础能力建设“十一五”规划》研究起草工作，成为国务院办公厅转发（[2007]7号）的《国家自主创新基础能力建设“十一五”规划》主要内容。政策与管理所承担并且完成了《实施〈国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006－2020年）〉的若干配套政策》中《扶持和激励企业成为创新主体政策》研究起草工作，提出的政策如“企业技术开发投入可按实际发生总额150%抵扣应税所得额，并允许跨年度结转”等均纳入配套政策；还参与《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006-2020）配套政策》中重要内容研究起草工作。

　　政策与管理所是中国可持续发展研究的开拓者。1992年，政策与管理所设置“可持续发展研究室”，开创了可持续发展系统学研究方向，以系统、综合的观点，探索可持续发展的本源和演化规律，有序地演绎可持续发展的时空耦合与三者互相制约、互相作用的关系，建立了“人与自然和人与人”等关系的定量评判规则。提出了可持续发展生存发展环境社会智力五大支持系统的理论架构，建立了一系列可持续发展指标体系，提出了可持续发展资产负债评价方法、综合国力评价方法、资源环境综合绩效评价方法、社会稳定预警方法，为可持续发展研究提供了技术支撑。1999年开始编纂的年度报告《中国可持续发展战略报告》及提交的政策咨询报告日益受到政府、学术界及相关机构的关注，推动了国内可持续发展研究，奠定了研究所在可持续发展研究领域处于的领先地位。此外，在区域发展战略与规划、区域资源配置、协调发展模式与区域优化管理模式等方面也取得一批有影响的研究成果，参与多项科技部国家级可持续发展试验区建设和科技示范市建设的咨询、规划、考核与评价。

　　近年来，政策与管理所加强了项目管理技术、项目风险管理理论与度量方法研究，在航空安全管理、突发事件应急管理研究方面取得了重要成果，涉及公共突发事件应急管理中应急系统、预案管理、资源优化配置、布局、调度。拓展了能源与环境政策研究，在能源环境经济复杂系统预测、决策及政策分析技术研究，为制定我国能源战略与能源环境政策提供了决策工具、分析平台和政策模拟系统。提出我国社会能源经济环境技术复杂系统SE3T理论框架，建立了我国能源复杂系统建模与政策研究多目标综合集成方法论，开发了我国中长期能源需求预测系统、国际原油价格预测系统和我国能源环境政策模拟分析系统等软件平台，形成了国家能源政策分析模拟核心技术，建立了针对能源经济、能源市场、能源效率与节能、能源安全、能源环境等问题的决策支持模型，形成了能源决策支持模型体系，为我国能源战略与政策制定提供了重要决策参考。